EMWのボトルの底にオリのような物がありますが、使用しても大丈夫でしょうか？

使用するうえで問題はありません。

オリやボトルの底に溜まるものは、微生物の代謝物や基質（エサ）などが固まったものです。
通常は軽く振ってご使用ください。

ただし、スプレーヤーなどで薄めて使用する場合は、オリがノズルに詰まる可能性がありますので、上澄み（上の方の澄んだ部分）のご使用をおすすめします。
また、洗濯に使用する場合も、上澄みをご使用ください。